阴阳神签源于中国道教文化，其核心哲学理念融合了阴阳五行学说。阴阳学说认为宇宙万物由相互对立的阴阳二气构成，五行学说则通过金、木、水、火、土五种元素的相生相克解释自然规律。这种世界观深刻影响了阴阳神签的占卜体系，使其成为一种结合天文、历法与人文的占卜工具。灵签内容往往蕴含阴阳平衡、五行调和的哲理，如“龙蟠千江谷，虎踞万山湖”的签文，既描绘自然景象，又暗含阴阳相生之意。

阴阳神签的起源可追溯至先秦时期的占卜传统，如《左传》中记载的“枚卜”和《楚辞》中的“筵”占卜法。这些方法通过竹块或草茎的投掷判断吉凶，与阴阳神签的掷杯占卜形式一脉相承。唐宋时期，随着道教与佛教的兴盛，灵签文化逐渐普及，签诗内容开始融入儒释道思想，成为民间信仰的重要组成部分。明清时期，阴阳神签在福建、广东等地广泛流传，并随着华侨传播至东南亚，成为华人社群中重要的精神寄托工具。